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黄海水产研讨所等单元完成鞍带石斑鱼基因图谱绘制

2019-8-23 6:11:37 人评论

青岛新闻网记者从黄海水产研究所得悉,日前在山东省农业良种工程等项目支持下,黄海水产研究所陈松林研究员团队、中山大年夜学林浩然院士团队和美国密歇根州立大年夜学李伟明教授团队等,联合完成了鞍带石斑鱼(龙胆石斑)的全基因组测序和基因组图谱绘制,并解析了其先天性…

  青岛新闻网记者从黄海水产研究所得悉,日前在山东省农业良种工程等项目支持下,黄海水产研究所陈松林研究员团队、中山大年夜学林浩然院士团队和美国密歇根州立大年夜学李伟明教授团队等,联合完成了鞍带石斑鱼(龙胆石斑)的全基因组测序和基因组图谱绘制,并解析了其先天性免疫和快速成长的基因组学机制。研究成果在国际重要学术刊物《分子生态本钱》(Molecular Ecology Resources)上在线发表。

  石斑鱼是我国重要的海水养殖经济鱼类。鞍带石斑鱼,俗名龙胆石斑、龙趸,是石斑鱼类中体型最大年夜、成长最快的一种石斑鱼,具有抗病力强、成长快速、滋味鲜美等特点,因此广泛应用于石斑鱼杂交育种和良种选育。作为体型最大年夜的肉食性岩礁鱼类,鞍带石斑鱼关于岩礁生态系统亦具有重要影响。

  研究人员采用二代测序和HiC三维基因组技能,构建了染色体水平的鞍带石斑鱼基因组图谱,结果显现鞍带石斑鱼基因组大小为1.086Gb,含有24718个蛋白编码基因。进化分析和共线性分析显现,鞍带石斑鱼与三棘刺鱼关系比来,分化光阴距今约1亿年,两者的部分染色体发生了融合或***;与其他鱼类基因组的比较基因组学分析创造,鞍带石斑鱼具有较完善的先天免疫系统,其中一些介入先天性免疫的基因家族(如NOD-like家族)发生了显著扩展,并发生了显著的DNA序列变革(正选择);同时,一些激素旗子暗记传导通路的关键基因亦遭到正选择,可能与其成长快速的生物学特色有关。

  鞍带石斑鱼基因组精细图谱的完成,为解析石斑鱼科鱼类成长、抗病等重要经济性状的分子机制奠定了重要根本;同时,鞍带石斑鱼全基因组数据也为石斑鱼杂交育种及良种选育技能的生长供应了有价值的基因本钱,关于推动石斑鱼产业的可持续生长具有重要意义。

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